Новый способ обнаружения микобактерий туберкулёза

Среди генетических семейств, выделяемых внутри вида Mycobacterium tuberculosis, для России особое значение имеют представители генотипа Beijing, встречающиеся более чем у половины больных туберкулезом, а кластер В0/W148 является наиболее распространенным в России вариантом генотипа Beijing. Представители этого кластера преобладают у больных с тяжелыми формами туберкулеза, демонстрируют высокую вирулентность и трансмиссивность, ассоциацию с лекарственной устойчивостью. Текущая эпидемия туберкулеза в России в значительной степени связана с активным распространением резистентных штаммов семейства В0/W148 в популяции, иммунизированной БЦЖ. Таким образом, своевременное выявление штаммов этого кластера является важной составляющей диагностики туберкулеза и имеет существенное значение для выбора адекватного лечения.

Для быстрой и однозначной детекции М. tuberculosis генотипа Beijing В0/W148 авторами предложен способ идентификации микобактерий туберкулеза кластера Beijing B0/W148, отличающийся тем, что применяют полимеразную цепную реакцию для амплификации фрагментов ДНК М. tuberculosis с подобранными праймерами P1, Р2 и Р3, последовательности которых представлены SEQ ID NO 1, 2, 3, соответственно, в режиме амплификации 98 °C - 10 мин., 30 циклов: 98 °C - 30 с, 64 °C - 30 с, 72 °C - 50 с, 72 °C - 10 мин., 4 °C, разделение продуктов амплификации проводят электрофорезом в 2 % агарозном геле, в случае получения фрагмента размером 1021 пн определяют штамм микобактерий туберкулеза кластера Beijing B0/W148.

Данный метод имеет ряд существенных преимуществ, таких как быстрота выполнения и возможность одновременного анализа большой коллекции образцов, однозначность интерпретации результатов, простое оборудование для постановки стандартной ПЦР-реакции и гель-электрофореза.

Разработанный способ является достаточно доступным в условиях специализированной лаборатории и занимает менее суток, что существенно быстрее по сравнению c методом IS6110-RFLP. Таким образом, предлагаемый способ обеспечивает высокую чувствительность и специфичность определения штаммов микобактерий туберкулеза генотипа Beijing B0/W148.

(См. Патент РФ № RU 2551764).

Все новости

ФБУН НИИ эпидемиологии
и микробиологии имени Пастера
Отдел новых технологий