Метод дифференциальной ПЦР-идентификации стрептококков групп С и G

Стрептококки являются одними из самых распространенных возбудителей инфекционных заболеваний у человека. К настоящему времени насчитывается более 50 видов стрептококков. Наиболее распространенными видами являются Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae и Streptococcus pneumoniae. Согласно классификации Lancefield, стрептококки дифференцируют по их принадлежности к разным серогруппам в зависимости от структуры и антигенных свойств полисахаридов, входящих в состав клеточной стенки. Так, например, Streptococcus pyogenes относят к серогруппе А, а S.agalactiae – к серогруппе В. В последние годы возрос удельный вес инфекций, вызываемых условно-патогенными стрептококками серогрупп С и G. Эти микроорганизмы колонизируют кожу, слизистые оболочки верхних дыхательных путей, эпителий кишечника и полового тракта. Они могут вызывать эндокардит, ревматическую лихорадку, менингит, синдром токсического шока и другие заболевания человека. Кроме того, они способны поражать животных, вызывая у них мастит, лимфаденит и заболевания респираторного тракта.

Важнейшим этапом микробиологической характеристики любого изолята является определение его видовой принадлежости. Согласно определителю бактерий Берджи, видовая дифференцировка стрептококков (по культуральным, морфологическим и биохимическим свойствам) как сложнокультивируемых микроорганизмов, является хотя и рутинной, но достаточно трудоемкой задачей и часто дает противоречивые результаты. Как правило, характеристика изолятов стрептококков обычно ограничивается определением их принадлежности к той или иной серогруппе, что недостаточно для решения задач эпидемиологии, требующей как минимум определения видовой принадлежности изолята. В связи с этим для идентификации стрептококков наиболее перспективными представляются генетические методы. В настоящее время все они основаны на сравнительном анализе нуклеотидных последовательностей различных фрагментов микробного генома: гена 16S pРНК, межгенной области 16S–23S рРНК, генов groEL, rnpB, sodA и других. Этот подход требует дорогостоящих оборудования и реагентов, что ограничивает его применение в клинических лабораториях.

В работе представлен экспресс-метод ПЦР-идентификации трех распространенных видов стрептококков групп С и G (Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis, Streptococcus constellatus и Streptococcus anginosus), вызывающих заболевания у людей. В качестве марке¬ров для ПЦР-диагностики были выбраны видоспецифичные области гена срn60, кодирующего белок теплового шока GroEL (НSР60); на эти области были сконструированы 3 пары праймеров, каждая из которых была специфична для конкретного вида. Метод апробирован на большой коллекции патогенных стрептококков разных серогрупп, полученных от людей и животных, показана его специфичность для идентификации S. dysgalactiae subsp. equisimilis, S. constellatus и S. anginosus. Предложенный метод характеризуется всеми преимуществами методов, основанных на ПЦР, что позво¬лит применять его в целях молекулярной эпидемиологии.(См. статью: Ильясов Ю.Ю. с соавт. "Метод дифференциальной ПЦР-идентификации стрептококков групп С и G").

"Клин. лаб. диагностика", 2011, № 2, с. 40 - 43.

Все новости

ФБУН НИИ эпидемиологии
и микробиологии имени Пастера
Отдел новых технологий