Молекулярно-генетическая характеристика вируса клещевого энцефалита в Крыму

Прогресс в изучении проблемы клещевого энцефалита (КЭ) в значительной мере обусловлен использованием молекулярно-генетических методов. Современная генетическая классификация основана на видовых признаках, объективно определенных по степени гомологии гена белка оболочки Е с полноразмерным геномом вируса КЭ (ВКЭ). С учетом различий в геноме выделяют 3 генотипа ВКЭ – дальневосточный (генотип 1), европейский, или западный, (генотип 2) и сибирской (генотип 3). Данные исследований стали базисом для создания диагностических, лечебно-профилактических препаратов; важным инструментом при организации эпидемиологического надзора за КЭ, в том числе с использованием ГИС-технологий. Эколого-эпидемиологические исследования с учетом генотипов ВКЭ позволили провести картографирование более 30 тысяч природных очагов КЭ в Северном полушарии от Европы до Японии. Каждый из генотипов вируса, как правило, доминирует на определенной территории, где в то же время могут циркулировать штаммы, относящиеся к иным генотипам.

В настоящее время данные о генетических особенностях популяции ВКЭ в Украине ограничены изучением двух штаммов. Штамм Семекс, изолированный в Волынской области, был отнесен к сибирскому генотипу, а изолированный в Крыму штамм Crimea – к дальневосточному.

Проведено определение нуклеотидных последовательностей гена белка оболочки Е трех штаммов ВКЭ 80, 85 и 290, изолированных из иксодовых клещей Ixodes ricinus в Крыму в 1989-1990 гг. Сравнительный анализ генетической структуры штаммов показал их идентичность. Филогенетический анализ этих штаммов с 34 другими штаммами ВКЭ позволил отнести их к европейскому генотипу вируса с максимальной идентичностью штамму Pan (97,24%), занимающему обособленное положение среди секвенированных штаммов ВКЭ. Полученные результаты указывают на то, что в 1980-1990 гг. в Крыму наряду с дальневосточным генотипом ВКЭ циркулировали штаммы европейского генотипа. (См. статью: Юрченко О.А. с соавт. “Молекулярно-генетическая характеристика вируса клещевого энцефалита в Крыму”).
"Вопр. вирусол", 2012, № 3, с. 40 - 43.

Все новости

ФБУН НИИ эпидемиологии
и микробиологии имени Пастера
Отдел новых технологий