Разработан новый неинвазивный способ диагностики инфекций

07.05.2019

Раннее обнаружение патогенных микроорганизмов при инфекционных заболеваниях было необходимо для своевременного и правильного назначения противомикробной терапии. Сегодня антибиотики часто назначаются в соответствии с клиническими рекомендациями и с учётом эпидемической ситуации до получения ответа микробиологической лаборатории. Это оправдано, поскольку выявление и характеристика патогенов занимает, как правило, не менее двух дней, а если речь идёт о труднокультивируемых микроорганизмах, срок ожидания ответа может значительно увеличиваться.

Методы ПЦР позволили значительно ускорить процесс диагностики, однако ПЦР позволяет выявлять только те патогены, исследование на которые назначил врач. «Karius test» — разработка компании Karius. Это методика, позволяющая в ходе одного теста исследовать кровь пациента на предмет присутствия ДНК 1250 различных бактерий, вирусов, грибов и паразитов. Она отличается высокой чувствительностью, с её помощью можно выявлять циркулирующую ДНК. Присутствие циркулирующей ДНК в крови не значит, что патоген находится в кровотоке. Под этим названием подразумевается внеклеточная ДНК, которая оказывается в крови при разрушении клеток патогена, которое неизбежно происходит при его столкновении с иммунной системой пациента.

В основе теста лежат методы метагеномики, поэтому технология рассчитана не на поиск определённых патогенов, а на выявление любых бактерий или вирусов. Предложенный метод направлен на обнаружение любой чужеродной ДНК в крови пациента. При исследовании 350 образцов крови от пациентов с септическими инфекциями было показано, что данная методика обладает большей чувствительностью, чем классические бактериологические методы. Исследование циркулирующей ДНК удобно применять, когда инфекция локализована в органах, получить материал из которых сложно, например, при инфекционных эндокардитах.

Чтобы данная разработка вошла в практику, её авторам предстоит решить ещё несколько проблем. Например, как различить стафилококковую инфекцию и широко распространённое среди здоровых людей носительство стафилококка, если в обоих случаях ДНК этих бактерий поступает в кровь? Пока что в этих случаях остаётся опираться на сведения о пациенте и дополнительные исследования.

Тем не менее, тест уже может рассматриваться в качестве дополнительного метода при экстренном определении возбудителя сепсиса или пневмонии, лихорадке неустановленной природы, а также когда с помощью всех доступных методов определить природу инфекционного агента не удалось.

Исполнение теста занимает 29 часов, но время диагностики существенно увеличивается из-за транспортировки, поскольку компания осуществляет его только в собственной лаборатории. Кроме того, тест является дорогим и обходится в 2000 долларов. Такие расходы оправданы, когда речь идёт о спасении жизни, но широкое внедрение исследования с подобной ценой невозможно. Разработчики планируют упростить процедуру, чтобы методика могла быть реализована в любой лаборатории, а также снизить цену, и это, конечно, должно способствовать доступности исследования.

неинвазивный способ диагностики инфекций

Также разработчики пока не решили, как включить в данный тест мишени в геномах разнообразных РНК-содержащих вирусов. К данной группе вирусов относятся возбудители таких опасных заболеваний, как лихорадка Зика и Денге, а также широко распространённые во всём мире ротавирусы и энтеровирусы.

O'Grady J.A. powerful, non-invasive test to rule out infection // Nat Microbiol. — 2019. — V.4, N.4. — P. 554-555.

Все новости
Регистрационные удостоверения
Награды сотрудников отдела
  • Лучший доклад молодых ученых «Новые концепции механизмов воспаления, аутоиммунного ответа и развития опухоли» V Международной научно-практической конференции. Государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образован
  • Диплом победителя конкурса «Лучшая работа молодого ученого» Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Актуальные проблемы эпидемиологии и профилактической медицины», г. Ставрополь, 22 – 24 октября 2014 г
  • Диплом «Победитель конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2014 г.»
  • Победитель Конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2010 г. Махлай Наталья Сергеевна
  • Победитель XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Ольга Валентиновна Заручейнова
  • Финалист XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Наталья Сергеевна Махлай
  • Победитель программы Участник молодежного научно-инновационного конкурса (УМНИК). Васильева Елена Викторовна. НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Отдел новых технологий
Факс
(812) 313-69-89
(812) 233-17-03