Молекулярно-генетический метод ускоренного выявления штаммов Bordetella pertussis, обладающих различными ptx генами

05.12.2008

Основная задача молекулярно-генетического типирования возбудителей инфекционных заболеваний, в частности, управляемых средствами специфической иммунопрофилактики – выявление эпидемических штаммов с генетической структурой, отличной от структуры штаммов, используемых для производства вакцинных препаратов. Бордетеллы таких штаммов способны сохраняться в иммунной популяции человека и вызывать рост заболеваемости даже среди привитых.

В последние годы в различных странах мира, в том числе в России, отмечен рост заболеваемости коклюшем среди детей школьного возраста, несмотря на высокий охват прививками детей раннего возраста. Одной из причин этого может служить изменчивость возбудителя. Анализ структуры различных генов у B.pertussis, в первую очередь ptxA гена, кодирующего основной протективный антиген коклюшного микроба – коклюшный токсин, выявил полиморфизм в этом гене. Согласно международной базе данных по генотипам (NCBI) у B.pertussis описаны шесть аллелей этого гена (ptxA1-ptxA6). Наиболее часто встречаются штаммы с ptxA1, ptxA2 и ptxA4 аллелями. Аллель ptxA5 обнаружена у единственного в мире штамма B.pertussis, который является референс-штаммом ВОЗ 18323. Показано, что ptxA2 и ptxA4 аллели являются "вакцинными" аллелями гена, то есть штаммы B.pertussis, используемые для производства цельноклеточных вакцин, обладают этими аллелями гена. С середины 80-х годов прошлого века штаммы B.pertussis, несущие "вакцинные" аллели этого гена (ptxA2 или ptxA4), постепенно вытесняются штаммами, несущими новую "невакцинную" аллель этого гена – ptxA1.

Для молекулярно-генетического типирования B.pertussis используются сиквенирование, пульс-электрофорез, мультилокусное сиквенирование, полимеразная цепная реакция с универсальными праймерами и другие. Данные методы типирования трудоемкие, требуют наличия специального и дорогого оборудования, что затрудняет их использование для анализа генетического полиморфизма большого числа штаммов B.pertussis.

Разработан молекулярно-генетический метод ускоренного выявления штаммов B.pertussis путем использования феномена эндонуклеазной рестрикции. Способ можно применять для дифференциации штаммов B.pertussis от B.parapertussis в диагностических целях. (См. статью: Борисова О.Ю. с соавт. "Молекулярно-генетический метод ускоренного выявления штаммов Bordetella pertussis, обладающих различными ptx генами").

"Журн. микробиол.", 2008, № 5, с. 80 - 83.

Все новости
Регистрационные удостоверения
Награды сотрудников отдела
  • Лучший доклад молодых ученых «Новые концепции механизмов воспаления, аутоиммунного ответа и развития опухоли» V Международной научно-практической конференции. Государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образован
  • Диплом победителя конкурса «Лучшая работа молодого ученого» Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Актуальные проблемы эпидемиологии и профилактической медицины», г. Ставрополь, 22 – 24 октября 2014 г
  • Диплом «Победитель конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2014 г.»
  • Победитель Конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2010 г. Махлай Наталья Сергеевна
  • Победитель XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Ольга Валентиновна Заручейнова
  • Финалист XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Наталья Сергеевна Махлай
  • Победитель программы Участник молодежного научно-инновационного конкурса (УМНИК). Васильева Елена Викторовна. НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Отдел новых технологий
Факс
(812) 313-69-89
(812) 233-17-03