Сравнительный анализ систем генотипирования ВИЧ-1 ViroSeq и Trugene в применении к вариантам вируса, распространенным в России

29.01.2010

ВИЧ-1 вызывает заболевание, которое без лечения неизбежно приводит к гибели больного. На сегодняшний день единственное средство, препятствующее прогрессированию болезни – комбинированная антиретровирусная терапия, которая заключается в одновременном применении нескольких ингибиторов ферментов, обеспечивающих размножение ВИЧ-1 – протеазы и обратной транскриптазы. Однако терапия может быть неэффективной, если вирус обнаруживает устойчивость к воздействию лекарственных средств. Резистентные штаммы чаще всего возникают в популяции de novo как результат неоптимального подбора препаратов или нарушения режима их приема. В последние годы все чаще регистрируются случаи первичного заражения устойчивыми вариантами ВИЧ-1.

Недостаточная эффективность лечения, приводящая к повышению вирусной нагрузки, служит основанием для применения альтернативных схем терапии. На сегодняшний день в мировой клинической практике широко используются несколько систем генотипировнаия ВИЧ-1 для обнаружения мутаций резистентности к лекарственным средствам, в частности ViroSeq (Abbott) и Trugene (Bayer HealthCare). Однако в России до настоящего времени был зарегистрирован и применяется только первый из названных тестов.

Целью настоящего исследования стало сравнение результатов использования обеих систем генотипирования ВИЧ-1 для выявления мутаций лекарственной устойчивости среди образцов ВИЧ-1, полученных от российских пациентов. Необходимо отметить, что в нашей стране распространен и доминирует уникальный вариант ВИЧ-1 IDU-A и значительно реже встречаются штаммы подтипа В, широко распространенные в мире. Поскольку в геноме вируса могут спонтанно возникать и даже постоянно присутствовать мутации, как проявление генетического полиморфизма в пределах подтипа и генетического варианта ВИЧ-1, представляло интерес также провести сравнительное изучение указанных тест-систем для обнаружения и мутаций полиморфизма варианта IDU-A ВИЧ-1.

Анализ 18 образцов от ВИЧ-инфицированных пациентов, получавших и не получавших специфическую терапию, показал, что совпадение при использовании тестов составило 95% (180 из 190 мутаций). При этом результаты выявления мутаций резистентности системами генотипирования ВИЧ-1 ViroSeq и Trugene совпали полностью. Показана возможность использования системы генотипирования ВИЧ-1 Trugene в клинико-диагностических лабораториях наряду с тест-системой ViroSeq. (См. статью: Казеннова Е.В. с соавт. "Сравнительный анализ систем генотипирования ВИЧ-1 ViroSeq и Trugene в применении к вариантам вируса, распространенным в России").

"Клин. лаб. диагностика", 2009, № 12, с. 46 - 51.

Все новости
Регистрационные удостоверения
Награды сотрудников отдела
  • Лучший доклад молодых ученых «Новые концепции механизмов воспаления, аутоиммунного ответа и развития опухоли» V Международной научно-практической конференции. Государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образован
  • Диплом победителя конкурса «Лучшая работа молодого ученого» Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Актуальные проблемы эпидемиологии и профилактической медицины», г. Ставрополь, 22 – 24 октября 2014 г
  • Диплом «Победитель конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2014 г.»
  • Победитель Конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2010 г. Махлай Наталья Сергеевна
  • Победитель XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Ольга Валентиновна Заручейнова
  • Финалист XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Наталья Сергеевна Махлай
  • Победитель программы Участник молодежного научно-инновационного конкурса (УМНИК). Васильева Елена Викторовна. НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Отдел новых технологий
Факс
(812) 313-69-89
(812) 233-17-03