Тестирование на вирус SARS-CoV-2: отказ от использования транспортной среды

07.09.2020

Срочная потребность в широкомасштабном клиническом или эпиднадзорном тестировании на SARS-CoV-2 требует пересмотра методов сбора, транспортировки, обработки и тестирования респираторных образцов.

Обычное тестирование на SARS-CoV-2 включает сбор клинического образца с помощью мазка из носоглотки, хранение мазка во время транспортировки в универсальной транспортной среде, выделение РНК и количественную ПЦР с обратной транскрипцией (RT-qPCR). По мере того, как тестирование охватывает весь мир, могут возникать проблемы поставок реагентов и комплектующих для каждого звена этой цепочки.

Для оценки возможности отказа от использования транспортной среды было проведено сравнение двух схем проведения анализа:

  1. общепринятая схема: мазок → транспортная среда → экстракция РНК → RT-qPCR;
  2. упрощенная схема: мазок →  элюирование из сухого мазка → RT-qPCR.  

 мазок из носоглотки

Результаты показывают, что использование сухих тампонов с последующим элюированием простым буферным раствором (ТЕ) не приводит к существенному снижению чувствительности анализа. Необходимо дальнейшее подтверждение эффективности такого подхода на больших выборках и вариациях других параметров.

S. Srivatsan, P. Han, K.  van Raay, C. Wolf, D.  McCulloch, A. Kim, E.  Brandstetter, B. Martin, J. Gehring, W. Chen, S. Kosuri, E. Konnick, C. Lockwood, M. Rieder4, D.  Nickerson, H. Chu, J. Shendure, L. Starita. Preliminary support for a “dry swab, extraction free” protocol for SARS-CoV-2 testing via RT-qPCR //bioRxiv, posted April 23, 2020. https://doi.org/10.1101/2020.04.22.056283.

Все новости
Регистрационные удостоверения
Награды сотрудников отдела
  • Лучший доклад молодых ученых «Новые концепции механизмов воспаления, аутоиммунного ответа и развития опухоли» V Международной научно-практической конференции. Государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образован
  • Диплом победителя конкурса «Лучшая работа молодого ученого» Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Актуальные проблемы эпидемиологии и профилактической медицины», г. Ставрополь, 22 – 24 октября 2014 г
  • Диплом «Победитель конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2014 г.»
  • Победитель Конкурса грантов Санкт-Петербурга для студентов, аспирантов, молодых ученых, молодых кандидатов наук 2010 г. Махлай Наталья Сергеевна
  • Победитель XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Ольга Валентиновна Заручейнова
  • Финалист XIV Конкурса бизнес-идей, научно-технических разработок и научно-исследовательских проектов Молодые, дерзкие, перспективные. Наталья Сергеевна Махлай
  • Победитель программы Участник молодежного научно-инновационного конкурса (УМНИК). Васильева Елена Викторовна. НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Отдел новых технологий
Факс
(812) 313-69-89
(812) 233-17-03